Documento avaliado pelos pares
Investigação de Target Mimics em dados públicos de lncRNAs
Autor
Tharcisio Soartes Amorim; Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Cornélio Procópio, Paraná, Brasil
Alexandre Rossi Paschoal; Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Cornélio Procópio, Paraná, Brasil
Resumen
Os MicroRNAs (miRNAs) compõem o tipo de pequeno RNA (small RNAs - sRNA) mais estudados. O miRNA maduro interage com o RNA mensageiro (mRNA) desempenhando um importante papel regulatório na expressão de genes nas plantas e animais. Os RNAs competidores endógenos (ceRNAs) são transcrições que possuem uma região similar ou igual a da ligação do miRNAs:mRNA, também conhecida como MRE. Deste modo, os ceRNAs podem regular os miRNA em nível de pós-transcrição ao competir pelo mesmo, liberando os mRNAs para tradução. Em 2017, Yuan e coautores disponibilizaram o banco de dados PceRBase, onde foram armazenados Target Mimics de 28 espécies de plantas, encontrados através de um pipeline de autoria própria. Neste contexto, este trabalho foi realizado com os objetivos de: atualizar a literatura, encontrando novos transcritos; desenvolver um pipeline próprio para encontrar novos Target Mimics, automatizando o processo para qualquer espécie de planta, e; realizar análise em espécies não analisadas anteriormente. Os resultados irão contribuir para a pesquisa de TMs em plantas