Objetivo Evaluar los efectos de la implementación de una reforma de Nueva Gestión Pública (NGP) que profesionaliza los cargos de dirección, sobre el desempeño de los hospitales públicos chilenos. Métodos Se construyó una base de datos para 181 hospitales públicos chilenos con información pública del año 2015. Se determinó el efecto generado por la permanencia en el cargo de dirección de un hospital público de quien fue seleccionado a través del Sistema de Alta Dirección Pública (SADP), mediante la estimación de cuatro modelos de regresión multivariada. Resultados La permanencia en el cargo de la persona seleccionada vía SADP se asocia positivamente con variables como el número de altas, la rotación de pacientes y la tasa de ocupación, denotando una mejora en la rentabilidad de los recursos disponibles. No se encuentra una relación significativa entre dicha variable y la disminución de la letalidad. Conclusiones Este trabajo proporciona evidencias acerca de los efectos sobre el desempeño de una reforma inspirada en la NGP, en particular, se muestra que la incorporación de profesionales con capacidad de gestión en cargos de alta dirección en hospitales públicos chilenos mejora su desempeño, relevándose la importancia del perfil profesional de quienes dirigen este tipo de organizaciones y recomendando ampliar el periodo de nombramiento de estos cargos.