In the need to study clean bioprocesses, hydrogen arises as a promising alternative of energy. Biomass provides a method for producing hydrogen and the degradation of organic waste through fermentation. A crucial aspect is the inhibition of bacteria consuming hydrogen. The effect of pretreatment of the seed was investigated to obtain a hydrogen-producing species from natural consortia. The study was carried out in batch tests. Two types of treatment were realized: acid enrichment and heat-shock. Three types of consortia were evaluated: soil, compost and sludge. The treated seed was grown at pH 5.5 and incubated at 35 °C. The heat treatment was more efficient and completely inhibited the methanogenic microorganisms. The consortium sludge exhibited a higher rate of production and compost a strong trend to increase production.En la necesidad de estudiar bioprocesos limpios, el hidrógeno surge como una alternativa prometedora de energía. La biomasa provee un método para la obtención de hidrógeno y la degradación de desechos orgánicos a través de la fermentación. Un aspecto crucial es la inhibición de bacterias consumidoras de hidrógeno. Se investigó el efecto del tratamiento preliminar del inóculo para obtener una especie productora de hidrógeno a partir de consorcios naturales. El estudio se llevó a cabo en cultivos batch. Se realizaron dos tipos de tratamiento: enriquecimiento ácido y shock térmico. Se evaluaron tres tipos de consorcios: tierra, abono y lodos. El inóculo tratado se cultivó a pH 5,5 y se incubó a 35 °C. El tratamiento térmico resultó más eficiente e inhibió totalmente los microorganismos metanogénicos. El consorcio de lodos exhibió una velocidad de producción más alta y el abono una marcada tendencia al aumento de la producción.