En el proceso de degradación anaeróbica de la materia orgánica la biodiversídad es muy compleja, tanto, que se han reportado más de 130 especies en un digestor anaerobio, debido a esto es de interés establecer la identidad de los grupos fisiológicos presentes en el lodo utilizado en reactores anaeróbicos. En la presente investigación, se usaron cargas de 2 y 3 kgDQO/m3d de glucosa. Los parámetros fisicoquímicos medidos fueron pH, DQO, temperatura, alcalinidad total, sólidos suspendidos volátiles, % de metano y volumen de biogás. Se utilizó la metodología convencional para el aislamiento e identificación de bacterias anaerobias. Los grupos fisiológicos encontrados en el lodo anaeróbico estudiado fueron: Bacterias fermentadoras de glucosa (BFG), Bacterias nitrato reductoras (BNR), Bacterias sulfato reductoras (BSR) y Bacterias metanogénicas (BM). Los resultados fueron homogéneos a lo largo del proceso de degradación anaeróbica mostrando que las variaciones de los parámetros fisicoquímicos inherentes al mantenimiento del reactor anaeróbico mesofilico, no influyeron en la biodiversidad encontrada.