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Biology and genetic diversity of SARS-CoV-2, the causative agent of COVID-19.
Biología y diversidad genética del SARS-CoV-2, agente causal de la COVID-19.
Registro en:
10.54139/salus.v25i3.127
Autor
Jaspe, Rossana C
Zambrano, José Luis
Loureiro, Carmen L
Sulbaran, Yoneira
Moros, Zoila C
Garzaro, Domingo
Rangel, Héctor R
Pujol, Flor H
Institución
Resumen
The infection generated by SARS-CoV-2 has caused more than 200 million cases and 4.5 million deaths worldwide. SARS-CoV-2 has accumulated mutations that allow it to be classified into different lineages. Some of these lineages have been designated variants by the WHO: under monitoring (VUM), of interest (VOI), or of concern (VOC). Methodology. Different strategies for genomic surveillance of these SARS-CoV-2 variants have been described in each country. In Venezuela, the strategies include the amplification of a fragment of the spike, PCR-RFLP, and sequencing of the complete viral genome, which has allowed us to monitor the introduction of VOCs and VOIs to the country. Results. By October 2021, in Venezuela, the circulation of three VOCs, Alpha, Gamma, and Delta, and the two VOIs (Lambda and Mu) have been described. Globally, the Delta variant predominates in practically all continents except some Latin American countries, although it is estimated that it will soon prevail in the region as well. Discussion. The circulation of variants in the countries is a very dynamic process and Venezuela does not escape from this reality; therefore, it is important to continue genomic surveillance of this virus. La infección generada por el SARS-CoV-2 ha causado más de 200 millones de casos y de 4,5 millones de muertes en todo el mundo. El SARS-CoV-2 ha ido acumulando mutaciones que permiten clasificarlo en diferentes linajes. Algunos de esos linajes han sido denominados variantes por la OMS: bajo vigilancia (VUM), de interés (VOI) o de preocupación (VOC). Metodología. Se han descrito diferentes estrategias para la vigilancia genómica de estas variantes del SARS-CoV-2 en cada país. En Venezuela las estrategias incluyen la amplificación de un fragmento de la espiga, PCR-RFLP y secuenciación del genoma completo viral, lo que nos ha permitido monitorear la introducción de VOCs y VOIs al país. Resultados. Para octubre de 2021, en Venezuela se han descrito la circulación de tres VOCs, Alpha, Gamma y Delta, y las dos VOIs (Lambda y Mu). Globalmente, la variante Delta predomina en prácticamente en todos los continentes salvo algunos países de Latinoamérica, aunque se estima que pronto prevalecerá también en la región. Discusión. La circulación de variantes en los países es un proceso muy dinámico y Venezuela no escapa de esta realidad; por ello es importante seguir la vigilancia genómica de este virus.