Tesis de Maestria
MÉTODO COMPUTACIONAL PARA LA MEDICIÓN AUTOMÁTICA DE HALOS DE INHIBICIÓN EN COLONIAS BACTERIANAS
Fecha
2017-07-05Autor
Saldaña Alcalde, Román Antonio
Institución
Resumen
Dentro de los métodos cuantitativos que se realizan en los laboratorios de microbiología clínica para el estudio de la sensibilidad que tienen diferentes bacterias a ciertos antibióticos se encuentra el método de disco de difusión. Este consiste en depositar discos impregnados con diferentes antibióticos en una superficie de agar de una placa de Petri previamente inoculada con el microorganismo. Después de cierto tiempo de incubación se forma un halo de inhibición alrededor de los discos, lo que indica la eficacia del antibiótico. Para medir la concentración se mide de forma manual el diámetro de la zona de inhibición con una regla, lo cuál es propenso a errores debido a la subjetividad del observador, cambios de ángulo del observador, suponer que siempre son círculos perfectos y fatiga visual ya que se toma demasiado tiempo de medición. En este artículo se propone automatizar el proceso de medición de halos de inhibición por medio de algoritmos de visión computacional. El proceso requiere tomar fotos en condiciones controladas con fondo amarillo las cuales son procesadas y binarizadas para obtener la región formada por el halo de inhibición. Esta región es buscada por medio de una curva paramétrica utilizando el algoritmo de descenso de gradiente para finalmente obtener el diámetro. Lo cuál ha mostrado resultados muy buenos en contra de las mediciones manuales disminuyendo el tiempo y la variación por paralaje.