Determinación de bacterias presentes en la rizósfera de Opuntia ficus-indica var. inermis en suelos áridos de Tumbes, Perú.

Abstract

Las investigaciones sobre la microbiota existe en la rizósfera de las plantas y sus propiedades benéficas en el desarrollo y promoción del crecimiento de las mismas, han sido actualmente temas preferidos por investigadores, por lo que el objetivo de la presente investigación se orienta a determinar las bacterias presentes en la rizósfera de Opuntia ficus - indica en suelos áridos de Tumbes, Perú. El material biológico procedió de la rizósfera de Opuntia ficus - indica. El cultivo de las cepas aisladas se procesó en Tripticase Soy Broth y Luria Bertani, a las cuales se le hizo extracción de ADN, luego se aplicó la técnica de la PCR; con lo que se obtuvieron los amplicones de las muestras tratadas; por último se realizó la electroforesis y la respectiva secuenciación por el gen 16S ADNr, y por el método de metagenómica se identificó las bacterias cultivables y no cultivables presentes en la rizósfera; el análisis de los datos se hizo mediante el programa MG – RAST, se consultó con BLAST del NCBI para la identificación de la especie, se concluye que se logró identificar 46 especies de bacterias cultivables presentes en la rizósfera de Opuntia ficus – indica, mediante metagenómica se logró la identificación de las bacterias nativas cultivables y no cultivables presentes en la rizósfera, encontrándose cerca de 600 géneros por punto de muestreo. Palabras clave: rizósfera, Opuntia ficus - indica, metagenómica.