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Alleles associated to disease severity index of mal de Río Cuarto disease in maize exotic germplasm
Alelos asociados al índice de severidad de la enfermedad mal de Río Cuarto en germoplasma exótico de maíz
Fecha
2020-10Registro en:
Rossi, Ezequiel Alejandro; Ruiz, Marcos; Bonamico, Natalia Cecilia; Balzarini, Monica Graciela; Alleles associated to disease severity index of mal de Río Cuarto disease in maize exotic germplasm; Sociedad Argentina de Genética; Journal of Basic and Applied Genetics; XXXI; 2; 10-2020; 45-53
1852-6233
CONICET Digital
CONICET
Autor
Rossi, Ezequiel Alejandro
Ruiz, Marcos
Bonamico, Natalia Cecilia
Balzarini, Monica Graciela
Resumen
El Mal de Río Cuarto (MRC) es una de las enfermedades virales más importantes del maíz en Argentina. El índice de severidad de enfermedad (ISE) permite combinar la incidencia y la severidad de una enfermedad en una métrica única. La reacción genotípica a MRC ha sido muy estudiada en poblaciones biparentales, sin embargo este carácter complejo no se ha analizado mediante estudios de mapeo por asociación. El objetivo del presente trabajo es identificar nuevos alelos de resistencia asociados con el ISE de la enfermedad MRC de maíz en un germoplasma exótico del Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT). Una población de líneas de maíz del CIMMYT se evaluó fenotípicamente en ambientes donde la enfermedad es endémica. Los predictores del efecto genotípico (BLUP, best linear unbiased predictor) del ISE de MRC y 78.376 marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) se usaron para realizar el mapeo por asociación en 186 líneas de maíz. Los componentes de varianza y los valores de heredabilidad sugieren una amplia variabilidad genotípica en la población de líneas. El mapeo por asociación permitió identificar 11 posibles QTL de resistencia a MRC. La incorporación de germoplasma exótico en los programas de mejoramiento de maíz locales podría contribuir favorablemente a la creación de genotipos híbridos con mayor nivel de resistencia a MRC. La capacidad predictiva de los marcadores asociados con la resistencia a MRC indican que la selección asistida por marcadores es una herramienta recomendable para seleccionar genotipos resistentes a MRC. Mal de Río Cuarto (MRC) is one of the most important viral diseases of maize in Argentina.The disease severity index (DSI) allows to combine the incidence and severity of a disease ina single metric. The genotypic reaction to MRC has been extensively studied in biparentalpopulations. However, this complex trait has not been analyzed by genome-wide associationstudies (GWAS). The aim of this work is to identify new resistance alleles associated withDSI of MRC in an exotic germplasm from the International Maize and Wheat ImprovementCenter (CIMMYT). A population of maize lines from CIMMYT was phenotypicallyevaluated in environments in the area where the disease is endemic. The predictors ofgenetic effects (BLUP, best linear unbiased predictor) and 78,376 SNP markers (SingleNucleotide Polymorphism) were used to perform the GWAS in 186 maize lines. The valuesof variance components and mean-basis heritability suggest a wide genotypic variabilityin the population. The GWAS allowed to identify 11 putative QTL of resistance to MRC. Theincorporation of exotic germplasm into local maize breeding programs could contributefavorably to the creation of hybrids with a higher level of resistance to MRC. The predictiveability of associated markers with MRC resistance indicates that marker-assisted selectionis an advisable tool for selecting MRC resistant genotypes.