doctoralThesis
Implementación de un sistema modelo diploide/tetraploide para el estudio genético y molecular de la apomixis en Paspalum rufum
Autor
Soliman, Mariano
Institución
Resumen
La apomixis es un modo de reproducción asexual por semillas que genera progenies
genéticamente idénticas a la planta madre. Esta característica es común en especies del género
Paspalum, donde las poblaciones naturales se organizan en complejos agámicos multiploides.
En estos sistemas, el citotipo diploide se reproduce por sexualidad, mientras que los
polipoloides, generalmente triploides y tetraploides, se reproducen por apomixis gametofítica
de tipo apospórica pseudógama. A pesar de esto, en varias especies del género, en especial en
P. rufum, se detectaron individuos diploides que producen sacos embrionarios apospóricos
(SEA) e incluso algunos son capaces de completar la apomixis.
El objetivo de este trabajo fue establecer un sistema de estudio de la apomixis a nivel
diploide y tetraploide en P. rufum. Para esto se trabajó en la generación y caracterización del
material vegetal, se estableció un sistema comparativo y se desarrollaron herramientas
moleculares para futuros estudios sobre los genes asociados al control de los componentes del
carácter.
En primer lugar, se realizó una caracterización de la transmisión de los componentes
de la apomixis, aposporía (SEA) y partenogénesis al nivel diploide. Se trabajó con una
población segregante F1 proveniente del cruzamiento entre dos genotipos diploides naturales,
ambos capaces de producir SEA en proporciones similares (5,77 %SEA y 13 %SEA) y con
capacidad diferencial de completar la partenogénesis (0% y 15%). Los análisis de segregación
del carácter “aposporía”, realizados mediante observaciones citoembriológicas, ajustaron a un
modelo dominante controlado por dos loci independientes. La determinación del %SEA en la
progenie F1 (entre 0% y 35,8 %SEA) reveló que la hibridación puede aumentar
significativamente la expresividad del carácter. Por otro lado, se confirmó que el grado de
expresividad de la aposporía se transmite desde los parentales a las progenies (F2) y es un
carácter estable para un mismo genotipo a lo largo del tiempo, sin embargo varía en diferentes
ambientes. La capacidad de formar semillas por apomixis fue evaluada en varios individuos
mediante citometría de flujo y se demostró que si bien algunos producen semillas apomícticas,
la mayor expresividad de la aposporía no se correlaciona con esta capacidad. Además, se
analizó la influencia del aumento de ploidía, en genotipos tetraploides artificiales, sobre la
expresividad de la aposporía y la apomixis. Estos análisis mostraron que la duplicación genómica permite incrementar el %SEA y la apomixis aunque esta no prevalece sobre la
sexualidad.
Para avanzar con el desarrollo de herramientas moleculares se utilizó la población F1
para generar un mapa de ligamiento genético a nivel diploide. Se construyeron dos mapas de
ligamiento mediante la inclusión de 627 marcadores de AFLP. Cada mapa quedó formado por
10 grupos de ligamiento (GL) cubriendo una longitud total de 1071,8 cM y 914 cM con una
distancia promedio entre marcadores de 4,78 cM y 4,53 cM y una distancia máxima entre dos
marcadores de 28,74 y 34,8 cM para el parental femenino y masculino, respectivamente. La
variación observada para la expresividad de la aposporía en la población nos llevó a realizar
una búsqueda de regiones asociadas a la misma mediante análisis de regresión simple. Se
comprobó la existencia de más de una región genómica asociada al carácter, localizadas
principalmente en dos GL.
Si bien se desconocen las vías moleculares que controlan la apomixis se ha postulado
que su expresión es posible gracias a la desregulación de los mismos genes que participan en el
desarrollo sexual y provocan una heterocronía en los procesos de desarrollo reproductivo. Con
el objetivo de probar esta hipótesis se comparó el desarrollo reproductivo sexual y apomíctico
entre los citotipos diploide y tetraploide, ambos con sexualidad y apomixis en diferentes
proporciones. Se evaluó la evolución de la esporogénesis y la gametogénesis femenina y
masculina, el crecimiento del ovario y la diferenciación de las células iniciales de la aposporía
(IA). Estos análisis mostraron diferente coordinación entre los procesos de desarrollo sexual y
apomíctico en el citotipo diploide respecto del tetraploide, observándose principalmente un
retraso de la meiosis femenina en los tetraploides. Se postula que esta característica podría estar
favoreciendo al desarrollo apomíctico al nivel poliploide.
Considerando la relación que existe entre las modificaciones epigenéticas y la expresión
de la apomixis se realizó un análisis comparativo de los perfiles de metilación entre genotipos
diploides, de la población F1, con diferentes %SEA, utilizando espiguillas en premeiosis y
postmeiosis. Se aplicó una técnica desarrollada recientemente denominada MCSeEd. Este
análisis reveló la presencia de cambios en la metilación asociados a los diferentes
comportamientos reproductivos. Se verificó además que varias de las secuencias
diferencialmente metiladas poseen homología con genes relacionados con procesos de
crecimiento y desarrollo reproductivo.
Los resultados obtenidos en la presente tesis permitieron caracterizar exhaustivamente
el desarrollo de la apomixis a nivel diploide y tetraploide en la especie P. rufum. Se desarrolló
el material vegetal diploide y tetraploide para continuar con los estudios moleculares de la
apomixis y comprender su control, así como la influencia que ejercen los aumentos en los
niveles de ploidía. Se construyó un mapa de ligamiento que será el punto de partida para
localizar los componentes de la apomixis en el genoma diploide. Por último, se implementó el
sistema diploide para un primer estudio comparativo a nivel molecular identificándose
variaciones epigenéticas relacionadas con el cambio del comportamiento reproductivo.
Además, se generó una base de datos de secuencias que serán de gran utilidad en estudios
posteriores para la identificación de los genes que intervienen en la regulación de la apomixis
a nivel diploide. Apomixis is an asexual mode of reproduction by seeds that generates maternal clonal
progeny. Although the character is mainly expressed at polyploid level, components of
apomixis have been detected at the diploid level in several species of Paspalum, including P.
rufum.
The objective of this work was to establish a comparative system for studying apomixis
at diploid and tetraploid levels in P. rufum. The activities performed include the generation and
characterization of the plant material, as well as, the development of molecular tools for further
analyses of genes controlling apomixis components.
The trans-generational transmission of apomixis components, apospory (AES) and
parthenogenesis, was analyzed in a segregating F1 population obtained by crossing diploid
genotypes producing similar proportions of AES (5.77% and 13%), but having different
capacity to complete parthenogenesis (0% and 15%). Cytoembryological observations revealed
that apospory segregates as a dominant character controlled by two independent loci.
Quantification of %AES showed that hybridity can increase it up to 35.8% and is transmitted
to successive F2 generations. Tetraploid genotypes artificially obtained revealed higher %AES
than its diploid counterparts. The evaluation of apomixis capacity by flow cytometry in diploid
hybrids showed that it is transmitted to the progeny, however a high %AES is not enough to
guarantee apomixis expression. Artificial tetraploid genotypes also increase apomixis capacity
in comparison to its original diploids but it varied depending on original diploid genotypes.
A genetic linkage map at diploid level was built in order to characterize the P. rufum
genome and search regions associated with expressivity of apospory. Two linkage maps with
ten linkage-groups (LG) were constructed for each parental genotypes covering a
recombination distance of 1071.8 cM (maternal) and 914 cM (paternal), respectively. A single
regression analysis allowed to find more than one genomic region modifying the character.
Reproductive development was characterized by cytoembryological observations of
ovaries and anthers during reproductive development. This assay showed a delay of female
reproductive development in tetraploid cytotype with respect to diploid cytotype, mainly at
meiosis. This behavior could favor apomixis development at the tetraploid level.
An epigenetic comparative analysis between diploid plants with low and and high %AES
was performed by applying the new MCSeEd technique. Results revealed that different
methylation patterns are related with reproductive development. Sequences differentially
methylated showed homology with genes related to growth and reproductive development.
Results obtained in this work contribute to generate the vegetal material for
characterizing apomixis and establishing a comparative system at both diploid and tetraploid
levels. The diploid system and the genetic linkage maps developed, as well as, the methylation
analysis performed will help for disclosing apomixis components operating in P. rufum. Fil: Apellido, Nombre. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina Soliman, Mariano. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina