La queratoconjuntivitis contagiosa ovina (QCO) es una enfermedad infectocontagiosa que produce ceguera temporal o permanente en ovinos y caprinos, se encuentra asociada a un conjunto de agentes infecciosos como Moraxella ovis, Mycoplasma conjunctivae y Chlamydia psittaci, el diagnóstico se realiza mediante un examen clínico y pruebas de laboratorio. De un total de 861 animales examinados, 209 presentaron algún tipo de lesión ocular resultando en una prevalencia del 24.27% de animales con lesiones compatibles con QCO. De las 209 muestras remitidas al laboratorio se lograron identificar 58 como Moraxella ovis mediante bacteriología y por la amplificación de los genes 16S rRNA y RxtA por PCR. En virtud de los resultados podemos concluir que Moraxella ovis esta involucrada en los casos de QCO en establecimientos productores de ovinos en el Estado de México.