Genetic variability in commercial subpopulations of creole colombian breed Romosinuano

Abstract

Genetic variability is of great importance when analyzing the conservation of genetic resources and also constitutes the basis for the process of genetic selection and improvement. The main objective of this study was to determine the genetic variability of the Colombian breed Romosinuano through molecular techniques. This study used 12 microsatellite markers to determine the genetic diversity and population structure in a total of 119 individuals of the Romosinuano breed and 42 of the Zebu breed, distributed in different geographical areas of the country. The highest average number of alleles (ANA) was in the subpopulation Universidad del Tolima (UT : 7.92) and the lowest value was in the subpopulation Bonanza (BO: 4.08). The polymorphic information content (PIC) for all studied markers was informative, finding ranges between 0.47 (BM 1818) and 0.71 (BM 2113), with an average in population of 0.64. The fixation indices FIS (-0.20), FIT (0.37) and FST (0.14) showed a deficit of heterozygotes. A phylogenetic tree was made using the Nei method, the lowest genetic distance was between subpopulations Guillermo Soto (GS) and Edem (ED), while the highest occurred between subpopulations El Brillante (BR), Universidad del Tolima (UT) and Fabio Torres (FT). There is high genetic variability among the populations, but moderate values of homozygosity within them, so it is necessary to give more importance to the management of this gene flow to reduce inbreeding. These results are an important basis for defining new plans for assisted selection and breeding.

La variabilidad genética es de gran importancia cuando se analiza la conservación de los recursos genéticos, además se constituye en la base para los procesos de selección y mejoramiento genético. El objetivo principal de este estudio fue determinar la variabilidad genética de la raza Romosinuano existente en Colombia por medio de técnicas moleculares. En este estudio se utilizaron 12 marcadores tipo microsatélites para determinar la diversidad genética y estructura poblacional en un total de 119 individuos de la raza Romosinuano y 42 de la raza Cebú, distribuidos en diferentes zonas geográficas del país. El valor más alto del número promedio de alelos (NPA) fue para la subpoblación de Universidad del Tolima (UT: 7,92) y el menor valor en la subpoblación Bonanza (BO: 4,08). El contenido de información polimórfica (PIC), para todos los marcadores estudiados fueron informativos, encontrándose rangos entre 0,47 (BM 1818) y 0,71 (BM 2113), con un promedio en la población de 0,64. Los índices de fijación FIS (-0,20), FIT (0,37) y FST (0,14), indicaron un déficit de heterocigotos. Se construyó el árbol filogenético, empleando la metodología de Nei, la menor distancia genética se presentó entre las subpoblaciones de Guillermo Soto (GS) y el Edem (ED), mientras que la mayor medida se presentó entre las subpoblaciones. El Brillante (BR), universidad del Tolima (UT) y Fabio Torres (FT). Existe una alta variabilidad genética entre las poblaciones, pero valores moderados de homocigosidad dentro de ellas, por lo que es necesario dar más relevancia al manejo de este flujo genético para reducir la consanguinidad. Estos resultados son una base importante para definir nuevos planes de apareamiento y selección asistida.