La amigdalectomía es la intervención quirúrgica más frecuente en otorrinolaringología y sus indicaciones son ampliamente conocidas en la especialidad. El avance en el conocimiento de sus funciones inmunológicas ha determinado su uso en el tratamiento de otras enfermedades tales como la nefropatía por IgA, síndromes neuropsiquiátricos, el síndrome de fiebre recurrente, algunas entidades dermatológicas, entre otras. Pretendemos así, revisar la literatura para evaluar la evidencia disponible que sustente lo que denominamos indicaciones no tradicionales. Al parecer, la evidencia a favor del uso de amigdalectomía en el tratamiento de algunas de estas enfermedades es sólido, mientras que para otras aún no supera la suposición teórica, pues sólo se cuenta con casos aislados. Consideramos necesario estudios más extensos, con mayor calidad metodológica para definir mejor la indicación de amigdalectomía. Esto, más la evaluación multidisciplinaria de cada caso nos debiera conducirá la mejor decisión.