Este artigo apresenta a articulação teórica conceitual fundamentada na teoria da atividade utilizada para o desenvolvimento de uma sistemática pedagógica que norteie a elaboração do projeto de simulação computacional. Foi elaborada e testada uma sistemática pedagógica que oriente a elaboração das etapas de projeto e desenvolvimento de uma simulação computacional para o ensino de graduação. São expostos conceitos relacionados a: simulação computacional; teoria da atividade; e aplicação da simulação computacional para fins de ensino e de aprendizagem dinâmica. É apresentado um ensaio teórico relacionado a uma proposta de organização pedagógica que norteia o planejamento e a execução de atividade de aprendizagem em ambiente de simulação computacional na perspectiva da teoria da atividade. Ao final são comentadas as considerações finais, destacando as contribuições da proposta de estruturação didática para a elaboração das diversas etapas do projeto de simulação e algumas indicações de oportunidades de futuras pesquias e estudos empíricos.