Dinâmica e evolução viral em diferentes escalas : da emergência à interação com o hospedeiro

Abstract

Vírus de RNA evoluem em escalas temporais curtas, os fazendo capazes de se adaptar a condições adversas rapidamente. De uma perspectiva temporal mais ampla, o histórico evolutivo dos vírus de RNA é marcado por uma origem primordial e extensa transferência horizontal de genes. Essas características são responsáveis pela vasta diversidade encontrada nesse grupo que permanece ainda pouco explorada. A integração do conhecimento de diversas áreas da ciência é necessária para melhor entendermos e melhor avaliarmos processos evolutivos importantes como mudança de hospedeiro, emergência de zoonoses e evasão da resposta imune; assim como para unificar diversidade viral e evolução viral em micro e macro escalas temporais. As pressões seletivas impostas pelo hospedeiro durante a replicação viral e eventos de transferência horizontal de genes são eventos intracelulares de alta relevância para a evolução e diversidade dos vírus de RNA. Nesta tese, estudamos a resposta celular de células do trato gastrointestinal de Drosophila melanogaster à infecção com dois vírus, thika virus (TV) e Drosophila melanogaster Nora virus (DMelNV), onde mostramos que esses vírus usam estratégias distintas para se replicar, e devido à resposta celular à infecção ser dependente de vírus e tipo celular, esses vírus estão sujeitos a pressões seletivas dependente de tipo celular; caracterizamos eventos de rearranjo entre dois tospovírus, tomato chlorotic spot virus (TCSV) e groundnut ringspot virus (GRSV), e mostramos que o segmento M do TCSV foi extinto ou permanece não sequenciado; e propomos novos critérios taxonômicos para a família Betaflexiviridae com base em análises evolutivas, onde demostramos a influência que eventos de recombinação exercem sobre a evolução e diversidade da família.