Trabajo de grado - Maestría
Genotipificación de SNVs de la región promotora de los genes IL-6, IL-1β, TNF-a asociados a respuesta inflamatoria en los fenotipos de Apnea Obstructiva del Sueño y Enfermedad Periodontal
Fecha
2022-03-04Registro en:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
Autor
Sir-Mendoza, Francisco Javier
Institución
Resumen
El objetivo del presente estudio fue determinar variantes de nucleótido único (SNVs) en la
región promotora de los genes IL-1β c.-511C>T, c.-31T>C; TNF-α c.-308 G>A; IL-6 c.-
572G>C, c.-174C>G, y los niveles de proteínas de estas citoquinas proinflamatorias en
saliva de individuos con apnea obstructiva del sueño (AOS) y periodontitis crónica (PC).
Se realizó un estudio de casos y controles que comprendió un total de 129 individuos de
Bogotá, Colombia. El grupo de casos fue subdividido en PC, AOS, PC más AOS. Para la
genotipificación se realizó extracción de ADN y amplificación por PCR para llevar a cabo
secuenciación Sanger. Los datos fueron analizados mediante estadística descriptiva e
inferencial con el programa R (v3.6.2). Los alelos IL-1β presentaron asociación significativa
(IL-1β c.-511T p=0.0007 (OR 2.83 IC: 1.57-5.10), IL-1β c.-31C p=0.001 (OR 2.81 IC: 1.51-
5.20)) y en sus estados homocigotos (IL-1β c.-511TT p=0.002 (OR 7.9 IC : 2.09-29.8),
IL-1β c.-31CC p=0.0001 (OR 7.2 IC: 1.8-27.9)). Estas estimaciones se obtuvieron al
comparar individuos con AOS vs controles, y sujetos con PC más AOS vs controles,
sugiriendo que individuos con estos SNVs poseen más de dos veces riesgo de desarrollar
estos fenotipos inflamatorios, incluso aumenta a más de 7 veces siendo homocigotos. En
ambos análisis, alélico y genotípico, el efecto de riesgo se mantuvo en pacientes
diagnosticados concomitantemente con ambas enfermedades. Este efecto puede ser
correlacionado con los niveles de proteínas, individuos IL-1β c.-511TT con PC más AOS
tuvieron mayores niveles de proteína IL-1β en saliva que controles IL-1β c.-511 CC (p=
0.011), así mismo, controles IL-1β c.-31TT vs PC más AOS IL-1β c.-31 CT (p= 0.001). Los
alelos de IL-1β analizados incrementan el riesgo de desarrollar AOS y/o AOS más PC
simultáneamente, siendo mayor en genotipos homocigotos. Por otro lado, se ha
identificado una nueva variante en IL-1β con un efecto protector (IL-1β c.4654A p=0.028
(OR 0.22 IC:0.06-0.7)). (Texto tomado de la fuente) The aim of the present research was to determine single nucleotide variants (SNVs) in the
promoter region of IL-1β (c.-511C>T, c.-31T>C), TNF-α (c.-308G>A), IL-6 (c.-572G>C,
c.-174C>G) gene, and the protein level of these proinflammatory cytokines in saliva of
individuals with Obstructive Sleep Apnea (OSA) and Chronic periodontitis (CP). A case and
control study that comprised a total 129 subjects from Bogotá, Colombia was conducted.
The cases group was subdivided into a group with only CP, only with OSA, and presenting
CP and OSA in concomitance. For genotyping, DNA extraction and PCR amplification were
performed to carry out Sanger sequencing. Descriptive and inferential statistic was
performed using R (v3.6.2). The IL-1β alleles had significant association (IL-1β c.-511T
p=0.0007 (OR 2.83 CI: 1.57-5.10), IL-1β c.-31C p=0.001 (OR 2.81 CI: 1.51-5.20)) as well
as its homozygous states (IL-1β c.-511TT p=0.002 (OR 7.9 CI : 2.09-29.8), IL-1β c.-31CC
p=0.0001 (OR 7.2 CI: 1.8-27.9)). These estimations were obtained when comparing
individuals with OSA vs Controls and subjects with CP + OSA vs Controls, suggesting that
individuals with the mentioned SNVs have two times more risk to develop these
inflammatory phenotypes and the risk is even seven times more when having two copies
of the allele. In both allelic and genotypes analyzes the risk effect of the SNVs was
maintained in patients diagnosed with both diseases. In addition, this genotypic effect
could be correlated to the protein level, homozygous individuals IL-1β c.-511TT diagnosed
simultaneously with OSA and CP had more IL-1β protein level in saliva than controls
IL-1β c.-511CC (p= 0.011), as well as when comparing controls IL-1β c.-31TT with OSA
and CP IL-1β c.-31 CT (p= 0.001). The alleles IL-1β c.-511T and IL-1β c.-31C increase the
risk of develop OSA and/or OSA with CP concomitantly, even more in a homozygous state.
Otherwise, a novel variant in IL-1β has been identified with a protective effect (IL-1β
c.4654A p=0.028 (OR 0.22 IC:0.06-0.7)). (Text taken fron the source)