Estandarización de las condiciones de PCR para la amplificación de citocromo oxidasa C, subunidad I (COI) y evaluación de su contenido informativo en dos poblaciones de Urotrygon aspidura del Pacífico vallecaucano [recurso electrónico]

Abstract

A pesar del gran porcentaje que representan los batoideos, en especial algunas familias como Urotrygonidae, en la fauna acompañante durante las faenas de pesca de camarón de aguas someras, pocos estudios de genética poblacional se han realizado en nuestro país en este grupo. Al no tener uso comercial, los individuos capturados son descartados, lo cual sea traducido en el poco interés existente en conocer más acerca de esta familia, generando vacios informativos a nivel ecológico, poblacional y genético. Esto hace necesario conocer la diversidad de esta familia con el ánimo de caracterizar las poblaciones naturales. Tanto en batoideos como en tiburones se ha empleado el gen citocromo oxidasa C subunidad I con propósitos poblacionales, por su alto contenido informativo y ciertas características (alta tasa de evolución molecular, tasa de sustitución nucleotídica superior con respecto a otros genes mitocondriales y poseer regiones conservadas que permiten el diseño de cebadores universales) que lo hacen útil en los estudios donde se busca discriminar especies y estimar la diversidad genética dentro de poblaciones de unidades biológicas poco estudiadas como Urotrygonidae . A partir de este trabajo se estandarizaron las condiciones para la amplificación por medio de PCR de un fragmento de este gen mitocondrial y se estimo el contenido informativo para dos poblaciones del Pacífico vallecaucano de Urotrygon aspidura (La bocana y Juanchaco). De acuerdo al análisis de 19 secuencias se hallaron 10 haplotipos no compartidos, se estimó la diversidad haplotípica y nucleotídica, encontrando que la población de La bocana posee menor diversidad que la de Juanchaco. De igual manera, el gen COI posee un alto contenido informativo, resultado útil para la discriminación de poblaciones en esta especie.