Characterization of a Trypanosoma cruzi genomic fragment complementary to several species-specific mRNAs but different from the spliced leader sequence

Abstract

We have isolated a clone of Trypanosoma cruzi genimic DNA, lambda 3b2-5, which contains sequences that are reiterated in the genome. Northtern blot analysis showed that clone 3b2-5 hybridizes to 1,200-5,000 bases different mRNA species. The number of mRNAs species hybridized to clone 3b2-5 exceeds its coding capacity showing that this clone carries sequences that are common to several mRNAs species and conserved in the poly A(+) RNA. These sequences are not homologous to the T. cruzi spliced leader sequence, since clone 3b2-5 hybridize to a synthetic 20 nucleotice complementary to the spliced leader sequence. Clone 3b2-5 does not hybridize to DNA and RNA from several genera of Trypanosomatidae and other Trypanosoma species indicating that it carries T. cruzi species-specific sequences.

Foi isolado um clone recombinante (lambda 3b2-5) de ADN genômico de Trypanosoma cruzi, o qual contém seqüências que estão reiteradas no genoma. Análise através da técnica de Northern blot mostrou que o clone 3b2-5 hibridiza com diferentes espécies de ARNs mensageiros de 1.200 a 5.000 bases. O número de espécies de ARNs mensageiros que hibridiza com o clone3b2-5 excede sua capacidade codante, sugerindo que este clone apresenta seqüências que são comuns a muitas espécies de ARNs mensageiros e conservadas no ARN poliadenilado. Estas seqüências não são homológas a seqüência líder presente nos ARNs de T. cruzi, pois, o clone 3b2-5 não hibridiza com um nucleotídeo sintético complementar a seqüência líder. O clone 3b2-5 não hibridiza com o ADN e ARN de diferentes gêneros de tripanosomatídeos e outras espécies de tripanosomas indicando que ele apresenta seqüências específicas para o T. cruzi.