Tesis
ANÁLISIS Y MODELADO MOLECULAR DEL FLUOROFORO, INTERRUPTOR Y SONDA DE UN BIOSENSOR PARA DETECTAR Mycobacterium tuberculosis
Autor
SANDRA MONICA ALVARADO GONZALEZ
Institución
Resumen
La tuberculosis (tb) es la principal causa de mortalidad a nivel mundial. La
tuberculosis, es una enfermedad infecciosa, causada por diferentes especies
del genero Mycobacterium, denominado complejo Mycobacterium tuberculosis
(Mtb), la especie más importante y representativa, causante de la tuberculosis
es Mycobacterium tuberculosis. Debido al lento crecimiento de la Mycobacteria
el aislamiento, la identificación y las pruebas de susceptibilidad tardan varias
semanas. IS6110 es un elemento de inserción que se encuentra
exclusivamente en los miembros del complejo M. tuberculosis y, por su
exclusividad, este resulta ser una herramienta de diagnostico muy importante.
Los Molecular Beacons (MB) son sondas que hibridan, formada por
oligonucleótidos de una sola cadena y forman estructuras de tallo-burbuja y a
su vez en los extremos de los brazos del tallo tienen un fluoroforo y un
interruptor unidos. Los Molecular Beacons indican la presencia de una ácido
nucleico específico. Son sondas que pueden monitorear la síntesis de ácidos
nucleicos en tiempo real, acoplados a la reacción en cadena de la polimerasa
(PCR) sin interrupción de la reacción. Cuando los MB están en presencia del
DNA blanco sufren un cambio de conformación y fluorescen. Los MB no
fluorescen en ausencia del blanco, por lo tanto, el tallo mantiene a estas dos
moléculas (fluoroforo e interruptor) muy próximos causando que la
fluorescencia del fluoroforo sea interrumpida por la transferencia de energía.
Debido a que el interruptor no es fluorescente emite la energía que recibió del
fluoroforo en forma de calor. La transferencia de energía del fluoroforo al
interruptor en este complejo se lleva a cabo por el mecanismo de Transferencia
de Energía por Resonancia de Fluorescencia (FRET), el cual solo ocurre
cuando la fluoroforo y el interruptor interactúan a una distancia de (10 a 100 Å).
En este trabajo se uso el paquete computacional Modeling Platform (OMP6;
DNA Software, Inc.) para obtener los valores teóricos de la temperatura de
desnaturalización (Tm) y de la energía libre de Gibbs (ΔG) y predecir
teóricamente la temperatura de desnaturalización del biosensor y del blanco.
Además se utilizo el paquete computacional Gaussian 03W y Gaussian View
3.09, para describir la interacción del complejo fluoróforo-interruptor empleando
la teoría de funcionales de la densidad (DFT).