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Detección de polimorfismos en la región codificante del gen receptor de hormona luteinizante mediante análisis de polimorfismo conformacional de cadena simple y secuenciación en bovinos Carora
Detection of polymorphisms within the coding region of luteinizing hormone receptor gene by single-strand conformation polymorphism analysis and sequencing in Carora cattle
Registro en:
0798-2259
199102ZU46
Autor
Vásquez Marín, Belkys Josefina
Márques Urdaneta, Alexis Feliciano
Seijas Pedroza, Geomar
De La Rosa, Oscar
Aranguren Méndez, José Atilio
Institución
Resumen
Con el objeto de caracterizar los polimorfismos nucleotídicos
simples (SNP) presentes en una región del exón 11 del gen receptor
de hormona luteinizante en bovinos Carora, se analizaron
98 muestras de ADN bovino pertenecientes al banco de
ADN del laboratorio de Biotecnología Agrícola de la Escuela
Socialista de Agricultura Tropical (ESAT). El ADN se extrajo
mediante una metodología de precipitación salina. Las secuencias
variantes fueron evidenciadas en primera instancia
por amplificación del segmento de interés y análisis de polimorfismo
conformacional de cadena simple (PCR-SSCP). Se
detectaron cuatro patrones electroforéticos en el fragmento estudiado.
Luego, 19 muestras representativas de cada uno de
los patrones fueron amplificadas y enviadas a un servicio de
secuenciación capilar estándar (Macrogen, Inc., Corea). Se
detectaron dos variantes en el fragmento de ADN evaluado:
rs41256848 (1410G>T) detectada previamente y una variante
nueva (1337C>T). Se detectaron dos alelos (G y T) y tres genotipos
(GG, GT, TT) para la variante rs41256848; y dos alelos
(C y T) y dos genotipos (CC, CT) para la variante nueva.
Las frecuencias alélicas para la variante rs41256848 fueron
0,852 – 0,147 para G y T, respectivamente; mientras que para
la nueva variante fueron 0,964 – 0,035 para C y T, respectivamente.
Las frecuencias genotípicas para rs41256848 fueron 0,7551 – 0,1938 – 0,0510 para GG, GT, TT, respectivamente;
para la variante nueva fueron 0,9285 – 0,0071 para CC, CT,
respectivamente. La muestra poblacional estudiada no se encuentra
en equilibrio de Hardy-Weinberg para la variante
rs41256848. Los resultados obtenidos en la presente investigación
demostraron la presencia de polimorfismos en el fragmento
de LHR estudiado, en animales Carora. 428 - 435 belkysvasquez68@gmail.com In order to characterize the simple nucleotide polymorphisms
(SNPs) within of exon 11 of the luteinizing hormone receptor
gene in Carora cattle, 98 bovine DNA samples belonging to
the DNA Bank Agricultural Biotechnology Laboratory of the
Socialist School Tropical Agriculture (ESAT) were analyzed.
The DNA is extracted by salting-out methodology. The variants
sequences were evidenced by amplification of the segment
and single strand conformation polymorphism analysis
(PCR-SSCP). Four electrophoretic patterns were detected in
the studied fragment. Then, 19 representative samples of
each of the patterns, were amplified and sent to a standard
capillary sequencing service (Macrogen, Inc., Korea). Two
variants were detected in the DNA fragment evaluated:
rs41256848 (1410G> T) previously detected and a new variant
(1337C> T). Two alleles (G and T) and three genotypes (GG, GT, TT) for variant rs41256848 detected; and two alleles
(C and T) and two genotypes (CC, CT) for the new variant. The
allele frequencies for rs41256848 variant were 0.852 - 0.147
for G and T, respectively; while for the new variant was 0.964 -
0.035 for C and T, respectively. The genotype frequencies for
rs41256848 were 0.7551 - 0.1938 - 0.0510 for GG, GT, TT, respectively;
for the new variant were from 0.9285-o 0.0071 for
CC, CT, respectively. The studied sample population is not in
Hardy-Weinberg equilibrium for the rs41256848 variant. The
results obtained in this investigation showed the presence of
polymorphisms in the LHR fragment studied in Carora animals.