The terminology used in the paleoanatomical study of gymnospermous woods, proceeding from Carboniferous and Permian of Gondwana, is characterized by vagueness of criteria regarding the selection of the characteristics of taxonomic value. In this regard, a greater negligence is comparatively emphasized in relation to the pith than the other units that composed the stem and the lack of uniformity in the nomenclature used in primary and secondary xylem paleoanatomy. Such procedures have led to elaboration of incomplete generic and specific descriptions, to the difficulty of comparison between the specimens and, often, to the inadequate taxonomic. Thus, aiming at the definition of the features of taxonomic value and the standardization of terminology, a methodology based on proposition and discussion of the anatomical characteristics of the pith and primary and secondary xylem used to inter-taxa differentiation of the Gondwana gymnospermous woods is presented. Notes about the anatomy of the other units of stem, neighboring the secondary xylem, and illustrations of taxa that exhibit the characters considered are also presented.A terminologia utilizada no estudo paleoanatômico de lenhos gimnospérmicos, oriundos do Carbonífero e Permiano do Gondvana, se caracteriza pela imprecisão de critérios com respeito à seleção das características de valor taxonômico. Neste aspecto, salienta-se ainda maior negligência em relação à medula, do que às outras unidades que compõem o eustelo caulinar, e a ausência de uniformidade nomenclatural na paleoanatomia dos xilemas primário e secundário. Tais procedimentos têm conduzido a elaboração de descrições genéricas e específicas incompletas, a dificuldade na comparação entre os espécimes e, muitas vezes, a um posicionamento taxonômico inadequado dos mesmos. Visando a definição dos aspectos de valor taxonômico e a padronização da terminologia, é aqui apresentada uma metodologia de estudo baseada na proposição e discussão dos caracteres anatômicos dos corpos medular e lenhoso utilizados na diferenciação inter-taxa em lenhos gimnopérmicos gondvânicos. Notas sobre a anatomia das demais unidades do eustelo caulinar, adjacentes ao xilema secundário, e ilustrações dos táxons que exibem os caracteres considerados são também apresentadas.