Tesis Doctorado
Estudio de la diversidad genética en poblaciónes de prochlorococcus y synechococcus de las capas oxicas y suboxicas asociadas a la zona de mínima de oxigeno del océano pacífico tropical sudoriental.
Autor
Gómez, Patricia
Universidad de Concepción
Institución
Resumen
La región tropical del Océano Pacífico Sudoriental abarca el ecosistema de surgencia costera
de mayor productividad biológica y una de las zonas de mínima de oxígeno (ZMO) más
extensas y someras del mundo. La presencia de una capa con bajo oxígeno a profundidades
intermedias juega un papel importante en la estructuración tanto de especies pelágicas como
de comunidades bentónicas, promoviendo un particionamiento vertical de los ensambles
planctónicos. Debido a la escasa información acerca de las picocianobacterias que habitan
tanto en la ZMO como en la costa del Océano Pacífico Sudoriental esta investigación se
enfocó en evaluar y comparar la composición y diversidad genética de las poblaciones de las
cianobacterias de los géneros Prochiorococcus y Synechococcus que habitan en aguas óxicas
y subóxicas del Océano Pacífico tropical oriental. Para cumplir con este objetivo se
analizaron 55 muestras de ADN comunitario utilizando el método de T-RFLP (Terminal
Restriction Fragment Lenght Polimorfism) y la secuenciación del espaciador interno transcrito
del 1 6S-23S rDNA, el cual es útil para discriminar entre taxa estrechamente relacionados. La
aplicación del método estándar de T-RFLP generó resultados anómalos presentando más de
una señal, incluso con muestras provenientes de fragmentos ITS donados. Por lo tanto se
realizó una modificación en el método que consistió en adicionar los partidores marcados en
los últimos dos ciclos de amplificación. Esta modificación permitió la aplicación del método
de T-RFLP al análisis de secuencias ITS en muestras de terreno. Por otro lado, la
secuenciación de la región ITS a partir de muestras ambientales demostró, principalmente, la
presencia de genotipos del género Prochiorococcus y la existencia de linajes nuevos,
asociadas a la ZMO, dentro de este género. El análisis filogenético de las secuencias ITS obtenidas de la base de datos GenBank y de la
donación y secuenciación de muestras ambientales, discriminó 19 linajes filogenéticos de
cianobacterias. La comparación entre las poblaciones analizadas mediante T-RFLP de
muestras ambientales y el uso de análisis estadísticos como T-TEST, SIMPER y ANOSIM
indicaron que: a) la diversidad de picocianobacterias en la ZMO es mayor que la de zonas
óxicas; b) la composición de la comunidad presente en la ZMO difiere de la de zonas óxicas,
principalmente por la presencia y abundancia de los linajes nuevos de Prochiorococcus.