The characterization of morphological diversity and molecular (DNA) of two cultivars of Cucurbita maxima Duch., C. moschata Duch. and C. pepo L. of the Lambayeque region, was performed using morphological traits and four microsatellites molecular markers of Cucurbitaceae. We used the IPGRI descriptor for cucurbits. The design of randomized complete block (BCA) was used for morphological and performance evaluations of the cultivars. In the analysis of the molecular characterization was determined coefiiente Jaccard similarity, genetic diversity index of Nei. Morphological analysis of cultivars of the species studied showed great variability of shape, color, fruit weight, petiole length, internode, etc. The total number of alleles found was 34. The similarity coefficients ranged from 0.603-0.728. The rate of heterozygosity (He) was 0.495, 0.463 and 0.476 for C. pepo L., C. maxima Duch. and C. moschata Duch. respectively. The microsatellite CMTP 21 presented the highest rate of polymorphism information.La caracterización de la diversidad morfológica y molecular (ADN) de dos cultivares de Cucurbita maxima Duch., C. moschata Duch. y C. pepo L. de la región Lambayeque, se realizó empleando descriptores morfológicos y cuatro marcadores moleculares de tipo microsatélites de Cucurbitáceas. Se utilizó el descriptor del IPGRI para Cucurbitáceas. El diseño de Bloques Completos al Azar (BCA), fue utilizado para las evaluaciones morfológicas y de rendimiento de los cultivares. En el análisis de la caracterización molecular se determinó el coefiiente de similitud de Jaccard, Índice de diversidad genética de Nei. El análisis morfológico de los cultivares de las especies estudiadas mostraron gran variabilidad de la forma, color, peso de los frutos, longitud de pecíolo, entrenudos, etc. El numero total de alelos encontrados fue 34 .El coeficiente de similitud fluctuó entre 0.603-0.728. El índice de Heterocigosidad (He) fue de 0.495, 0.463 y 0.476 para C. pepo L., C. maxima Duch. y C. moschata Duch. respectivamente. El microsatélite CMTp 21 presentó mayor índice de polimorfismo informativo.