Objetivo: Avaliar a condição gengival e a presença na microbiota subgengival das bactérias Aggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa) e Tannerella forsythia (Tf) em pacientes periodontalmente saudáveis submetidos a tratamento ortodôntico com aparelho fixo. Material e Métodos: Vinte pacientes foram distribuídos em dois grupos (n=10) de acordo com a necessidade de tratamento ortodôntico (Grupo Teste = apresentavam má oclusão e receberam tratamento ortodôntico; Grupo Controle = sem má oclusão e não receberam tratamento ortodôntico). Amostras microbiológicas foram coletadas com 0, 90 e 180 dias em quatro sítios pré‐estabelecidos: primeiro molar superior direito, primeiro molar inferior esquerdo, incisivo central superior direito e incisivo central inferior esquerdo. O DNA foi extraído para detecção dos patógenos periodontais Aa e Tf utilizando a técnica da Reação em Cadeia Polimerase. O índice de placa e sangramento gengival também foram registrados nos referidos intervalos de tempo. Resultados: As médias do índice de placa reduziram no grupo Teste e no grupo Controle. Quanto à presença de cada uma das bactérias, se destaca que aos 90 e aos 180 dias foi observada a presença no grupo Teste de Aa, aos 90 dias foi observada a presença de Tf no grupo Teste e no grupo Controle. Conclusão: Concluiu-se que a terapia ortodôntica fixa promoveu a presença dos periodontopatógenos estudados e não aumentou o índice de sangramento gengival e o índice de placa