Fatores ambientais, genéticos e hormonais contribuem para etiopatogênese do Lúpus Eritematoso Sistêmico (LES). As infecções pelos vírus das hepatites B (HBV) e C (HCV), foram também referidas como agentes etiológicos em algumas doenças auto-imunes. Poucos são os estudos sobre a soroprevalência dessas viroses em pacientes lúpicos, portanto, o objetivo da pesquisa foi determinar a soroprevalência do HBV e HCV, em pacientes portadores do LES. Foram entrevistados 169 pacientes lúpicos e coletadas amostras sanguíneas. Pesquisou-se os marcadores sorológicos para o HBV (HBsAg, anti-HBc total e anti-HBs) e HCV (anti-HCV). Nas amostras anti-HBc total e anti-HCV positivas foram pesquisados o HBV-DNA e HCV-RNA, pela reação em cadeia da polimerase (PCR). A prevalência do anti-HBc total foi 10,1% (17/169), com negatividade para o HBV-DNA. Em contrapartida, o anti-HCV esteve presente em três pacientes (1,8%), mas apenas um foi HCVRNA positivo, com carga viral de 212.000 cópias/mL. Portanto, a soroprevalência do HCV encontrada na pesquisa foi menor do que a verificada em pacientes lúpicos brasileiros. Por outro lado, em virtude da inexistência de outros trabalhos brasileiros que relatem a prevalência do HBV em pacientes lúpicos, verificou-se que a prevalência encontrada na pesquisa foi superior a da população localConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico