La perspectiva sistémica ha sido aplicada extensamente al estudio de la innovación, dada la existencia de múltiples agentes heterogéneos cuya interacción permite la generación, difusión y uso del conocimiento. Sin embargo, tal interacción presenta dificultades por las brechas existentes entre los agentes, siendo los intermediarios los responsables de construir puentes y facilitar la vinculación. No obstante, analizar el impacto de los intermediarios no es fácil, principalmente por el problema de atribución, que reduce muchas aproximaciones a fotografías carentes de análisis dinámico y longitudinal. Este trabajo propone superar tales limitaciones mediante simulación basada en agentes, la cual ayuda a ampliar el entendimiento del fenómeno de la intermediación en los sistemas de innovación y su impacto en el desempeño.