En los últimos años las empresas han puesto énfasis en ofrecer productos con una mejor calidad, esto se logra mediante la aplicación de Sistemas de Calidad que incluyan a todos los procesos que se hacen en una empresa. En el presente trabajo se diseña un Sistema de Gestión de la Calidad para el Equipo de Auditoría Tributaria a Instituciones Financieras de la Unidad de Auditoría Tributaria del Servicio de Rentas Internas del Ecuador, este sistema se basa en las teorías de Calidad Total y en la Norma Internacional ISO 9001, el estudio incluye todos los procesos relacionados con la Determinación Tributaria del Impuesto y la Estandarización de los papeles de trabajo que se utilizan para esta actividad. La finalidad de este estudio es dar una guía para la implementación de este tipo de Sistemas en Instituciones Gubernamentales con el fin de que brinden mejores productos o servicios a la ciudadanía.