La bacteriosis común es una enfermedad que puede ocasionar pérdidas en rendimiento superiores al 40% en variedades comerciales susceptibles. El objetivo del estudio fue confirmar la resistencia a aislamientos de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) de Honduras en líneas seleccionadas de las poblaciones X069 y X0104 derivadas de la cruza Tío Canela 75/VAX6, mediante evaluaciones fenotípicas y moleculares. El ensayo se realizó en el Laboratorio de Biotecnología y en camas de infección en la Escuela Agrícola Panamericana, El Zamorano, Honduras. Se reactivaron seis aislamientos de Xap de la colección del Programa de Investigación en Frijol (PIF) en medio de cultivo LDCA (levadura dextrosa carbonato de calcio agar), y se obtuvieron nuevos aislamientos de Xap de hojas de plantas infectadas de seis localidades de Honduras. Estos aislamientos se evaluaron y seleccionaron de acuerdo a su virulencia en la variedad Catrachita. Se caracterizó la variante fuscans de Xap en la cepa EAP 9506 en medio agar nutriente (AN). Se evaluaron 40 líneas F6 de las poblaciones X069 y X0104, los testigos Catrachita (susceptible) y VAX3 (resistente), y los padres Tío Canela 75 y VAX6, con las cepas EAP 9504 y 9506 y con los nuevos aislamientos de las localidades de Zorrales, El Rancho, Jamastrán, San Matías, Jacaleapa y El Paraíso de Honduras. Se empleó la escala de severidad del daño de 1-9 para evaluar la reacción de la inoculación. La evaluación fenotípica se realizó en dos ensayos; el primero inoculado con los aislamientos EAP 9504 y EAP 9506 y el segundo con los nuevos aislamientos de Xap de Zorrales, El Rancho y EAP 9506. Para la evaluación molecular se usaron los marcadores SCAR SU91 y SAP6, asociados a QTL (locus de características cuantitativas) de resistencia a aislamientos virulentos de Xap; y el marcador SCAR SR2 ligado al gen bgm-1 para evaluar la resistencia al Virus del Mosaico Dorado Amarillo del Frijol (VMDAF). Cuatro aislamientos Xap de la colección PIF presentaron síntomas de alta susceptibilidad en plantas de Catrachita. De los nuevos aislamientos sólo las plantas inoculadas con el aislamiento de Zorrales presentaron reacción de susceptibilidad (alta severidad de daño). Se comprobó que el aislamiento EAP 9506 pertenece a la variante fuscans de Xap, debido a que produjo melanina en el medio AN. En la evaluación fenotípica de las líneas seleccionadas de las poblaciones X069 y X0104 presentaron promedios de severidad de 2,7 a 3,9. En el segundo ensayo se observó una reducción en el grado de severidad de la cepa EAP 9506. En la evaluación molecular, con el marcador SAP6, se determinó que las 40 líneas, los padres y el testigo VAX3, presentaron el gen de resistencia al aislamiento EAP 9506. Con el marcador SU91, se identificaron 34 plantas resistentes y seis susceptibles; y con el marcador del gen bgm-1 (SR2) se identificaron 23 plantas resistentes y 17 susceptibles, y ambos marcadores (SAP6 y SU91) estaban presentes en las 34 líneas resistentes.