Actas de congresos
Análise in sílico da homologia do gene Serk em Gossypium hirsutum L. e espécies correlatas.
Author
SOARES, T. da C.
LIMA, L. M. de
SILVA, C. R. C. da
SANTOS, I. L. V. de L.
CARVALHO, J. M. F. C.
MELO FILHO, P. de A.
SANTOS, R. C. dos
Institutions
Abstract
Nesse trabalho procedeu-se a uma análise in silico buscando homologia do SERK entre acessos de G. hirsutumL. e outras espécies relacionadas, com sequências depositadas em banco de genes (www.ncbi.nlm.nih.gov). As espécies selecionadas foram: G. hirsutum, Theobroma cacao, Citrus sinensis, Vitis vinifera, Glycine max e Phaseolus vulgaris. Sequências completas do gene (mRNA) foram alinhadas por meio do programa ClustalX (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) para estimativa da similaridade gênica. A seguir, procedeu-se análise da proteína codificante pela ferramenta Blastx, do NCBI. Verificou-se que o gene SERK1 possui poucas regiões conservadas entre as espécies, contudo, foi observada homologia entre as sequências de G. hirsutum e Theobroma cacao com maior identidade na ordem de 86% e bit-score 681. Essa mesma relação (93%) foi observada entre as sequências de Phaseolus vulgaris e Glycine max com bit-score no valor de 1036, o que é esperado por se tratar de duas leguminosas, hermafroditas e cleistogâmicas. A espécie mais distante evolutivamente entre as demais foi aVitis vinífera. Baseando-se na análise dos aminoácidos, verificou-se alto grau de conservação dos principais domínios catalíticos. A proteína SERK possui domínio catalítico da serina/ treonina-kinase e pertence a uma subfamília envolvida em várias vias de sinalização, entre elas a restrição de proliferação de células em início de diferenciação. 2016